MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 30871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007797	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007797	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007797	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007797	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007797	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	88607943
7	NC_007797	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
8	NC_007797	CG	3	6	173	178	0 %	0 %	50 %	50 %	88607943
9	NC_007797	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
10	NC_007797	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
11	NC_007797	TC	3	6	262	267	0 %	50 %	0 %	50 %	88607943
12	NC_007797	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
13	NC_007797	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
14	NC_007797	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
15	NC_007797	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
16	NC_007797	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
17	NC_007797	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
18	NC_007797	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607943
19	NC_007797	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
20	NC_007797	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
21	NC_007797	AACT	2	8	945	952	50 %	25 %	0 %	25 %	88607943
22	NC_007797	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
23	NC_007797	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
24	NC_007797	AAGA	2	8	1022	1029	75 %	0 %	25 %	0 %	88607943
25	NC_007797	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
26	NC_007797	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
27	NC_007797	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
28	NC_007797	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88607943
29	NC_007797	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607943
30	NC_007797	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
31	NC_007797	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
32	NC_007797	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	88607943
33	NC_007797	ATTATG	2	12	1304	1315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607943
34	NC_007797	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
35	NC_007797	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
36	NC_007797	AC	3	6	1476	1481	50 %	0 %	0 %	50 %	88607943
37	NC_007797	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	88607943
38	NC_007797	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
39	NC_007797	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
40	NC_007797	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
41	NC_007797	A	7	7	1694	1700	100 %	0 %	0 %	0 %	88607943
42	NC_007797	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	88607943
43	NC_007797	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
44	NC_007797	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
45	NC_007797	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
46	NC_007797	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	88607943
47	NC_007797	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
48	NC_007797	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
49	NC_007797	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	88607943
50	NC_007797	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607943
51	NC_007797	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	88607943
52	NC_007797	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
53	NC_007797	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
54	NC_007797	A	6	6	2464	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	88607943
55	NC_007797	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
56	NC_007797	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
57	NC_007797	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
58	NC_007797	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
59	NC_007797	TA	3	6	2800	2805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007797	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607073
61	NC_007797	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607073
62	NC_007797	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	88607073
63	NC_007797	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607073
64	NC_007797	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	88607073
65	NC_007797	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607073
66	NC_007797	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607073
67	NC_007797	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607073
68	NC_007797	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	88607073
69	NC_007797	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88607073
70	NC_007797	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607073
71	NC_007797	A	6	6	3356	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	88607073
72	NC_007797	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607073
73	NC_007797	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607073
74	NC_007797	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607073
75	NC_007797	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607073
76	NC_007797	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607073
77	NC_007797	T	9	9	3594	3602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007797	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007797	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	88607911
80	NC_007797	CTAT	2	8	3701	3708	25 %	50 %	0 %	25 %	88607911
81	NC_007797	T	6	6	3726	3731	0 %	100 %	0 %	0 %	88607911
82	NC_007797	TC	3	6	3745	3750	0 %	50 %	0 %	50 %	88607911
83	NC_007797	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607911
84	NC_007797	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88607911
85	NC_007797	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	88607911
86	NC_007797	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607911
87	NC_007797	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607911
88	NC_007797	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607911
89	NC_007797	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607911
90	NC_007797	TA	3	6	4332	4337	50 %	50 %	0 %	0 %	88607911
91	NC_007797	T	6	6	4345	4350	0 %	100 %	0 %	0 %	88607911
92	NC_007797	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	88607911
93	NC_007797	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607015
94	NC_007797	G	6	6	4447	4452	0 %	0 %	100 %	0 %	88607015
95	NC_007797	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607015
96	NC_007797	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607015
97	NC_007797	GGCTTT	2	12	4700	4711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607015
98	NC_007797	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607015
99	NC_007797	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607015
100	NC_007797	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607015
101	NC_007797	A	6	6	5033	5038	100 %	0 %	0 %	0 %	88607015
102	NC_007797	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007797	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007797	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007797	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007797	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007797	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007797	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007797	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007797	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007797	ATCT	2	8	5613	5620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007797	CTAT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007797	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007797	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007797	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007797	AAAT	2	8	5824	5831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007797	A	6	6	5922	5927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007797	ATTA	2	8	5944	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007797	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007797	CAAT	2	8	5980	5987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007797	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007797	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007797	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007797	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007797	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607386
126	NC_007797	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607386
127	NC_007797	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607386
128	NC_007797	AG	3	6	6319	6324	50 %	0 %	50 %	0 %	88607386
129	NC_007797	A	6	6	6340	6345	100 %	0 %	0 %	0 %	88607386
130	NC_007797	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607386
131	NC_007797	AAAG	2	8	6402	6409	75 %	0 %	25 %	0 %	88607386
132	NC_007797	GATT	2	8	6456	6463	25 %	50 %	25 %	0 %	88607386
133	NC_007797	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607386
134	NC_007797	ATTT	2	8	6584	6591	25 %	75 %	0 %	0 %	88607386
135	NC_007797	T	6	6	6603	6608	0 %	100 %	0 %	0 %	88607386
136	NC_007797	TTTG	2	8	6621	6628	0 %	75 %	25 %	0 %	88607386
137	NC_007797	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607386
138	NC_007797	A	6	6	6672	6677	100 %	0 %	0 %	0 %	88607386
139	NC_007797	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88607386
140	NC_007797	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607386
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271	NC_007797	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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